O aeroporto tem dois terminais - T1 e T2, que estão ligados na parte pública por um corredor interno com cerca de 150 metros de comprimento. Pode deslocar-se entre eles a pé ou no exterior.

Na zona de trânsito atrás do posto de controlo de segurança, os dois terminais estão ligados numa única secção de partidas. Qualquer que seja o terminal pelo qual se passe pela segurança, este conduz sempre à zona de trânsito comum.

Os terminais estão divididos por companhia aérea e não por destino.

• Terminal 1 - Air Serbia, British Airways, Cyprus Airways, easyJet, El Al, Jet2.com, Swiss, Tarom, Turkish Airlines, Wizz Air
• Terminal 2 - Aegean Airlines, airBaltic, Austrian, Enter Air, Eurowings, Lufthansa, Norwegian, Olympic Air, Ryanair, SAS, Sky Express, Smartwings, Transavia, Volotea

Os balcões de check-in estão sempre no primeiro andar, o rés do chão está reservado para as chegadas.

O aeroporto é, em geral, muito claro e moderno.

Hotéis baratos perto do aeroporto de Salónica

Transferências entre voos

O aeroporto de Salónica é utilizado principalmente pela Aegean Airlines para fazer a ligação entre os seus voos europeus e os voos para as ilhas gregas. Salónica é um aeroporto muito mais agradável para transferências do que o ATH de Atenas.

O transbordo é muito fácil e direto, basta seguir os sinais "Ligações de voo". Na maior parte das vezes, a ligação é feita dentro do espaço Schengen, não sendo necessário passar por qualquer controlo.

A transferência de um voo para outro em Salónica pode ser feita em 25 minutos.