O aeroporto de Malta tem um terminal relativamente pequeno para os passageiros.
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Por conseguinte, pode estar muito cheio nas horas de ponta, especialmente de manhã cedo e por volta do meio-dia, pelo que deve estar preparado para uma escassez de lugares e filas de espera mais longas, até 30 minutos, para os controlos de segurança.
Os balcões de check-in das partidas estão situados no lado esquerdo do terminal e os das chegadas no lado direito. O registo de segurança situa-se no primeiro andar.
O terminal é organizado, mas a área depois do controlo de segurança é apertada e não comporta o volume de tráfego.
Transferências entre voos
Se estiver a fazer uma ligação entre voos dentro do espaço Schengen, basta seguir os sinais "Connecting Flights" e não é necessário sair da área de trânsito. No entanto, passará por um posto de controlo de segurança reservado apenas aos passageiros em transferência.
Se vier de um país não Schengen para um voo de regresso a um país não Schengen, não precisa de passar pelo controlo de passaportes e passará pelo controlo de segurança diretamente para a porta de embarque.
Se estiver a fazer uma transferência de um voo Schengen para um voo não Schengen ou vice-versa, terá sempre de sair da zona de trânsito e fazer novamente o registo.