O único terminal do aeroporto de Heraklion tem um aspeto antiquado e, na época de verão, fica muito congestionado. No entanto, a orientação não é difícil e as distâncias entre o check-in e os aviões são curtas.
O terminal tem um único piso térreo. A maior parte está reservada para os balcões de check-in e para as partidas, havendo apenas uma secção mais pequena no extremo esquerdo que serve as chegadas.
Na época de verão, prepare-se para a extrema escassez de lugares e para filas de segurança que podem chegar aos 40 minutos.
Transferências entre voos
O aeroporto de Heraklion não é um centro de transferências e, por conseguinte, não dispõe de uma opção de transferência direta através da zona de trânsito.
No caso de efetuar um transbordo em Heraklion por sua conta, terá de sair, fazer novamente o check-in e voltar a passar pela segurança.
