O aeroporto de Corfu tem um único terminal pequeno, que tem apenas um piso térreo.
A sala de partidas situa-se no lado esquerdo do edifício (quando visto do exterior), enquanto a área de chegadas se situa no extremo direito. Durante a época de verão, o terminal não tem capacidade para o número de voos e há falta de lugares e filas de espera mais longas para o controlo de segurança (até 30 minutos).
O terminal está aberto 24 horas por dia.
Transferências entre voos
Corfu não é um importante centro de transferências, pelo que não dispõe de uma opção de transferência direta através da zona de trânsito.
Se planear fazer uma transferência por conta própria, tem sempre de sair da zona de trânsito, fazer novamente o check-in e voltar a passar pela segurança.